生物有机肥指特定功能微生物与主要以动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。

有机肥料是指含有有机物质，既能为农作物提供多种有机养分和无机养分，又能培肥改良土壤的一类肥料。有机肥料主要材料来源于植物或动物废弃物或者残体，通过多种方式（如发酵、高温等）消除其有毒有害物质，利用其本身富含的大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及氮、磷、钾在内的丰富的营养元素，不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性。
有机肥常见类型
1 固态或者液态农家肥（堆肥、沤肥、沼肥、厩肥、绿肥等）
2 工厂化固体有机肥（市场上买到的袋装有机肥）
使用过程存在的弊端
1 制作麻烦，耗时久，占用大量空间场地。
2 各种养分含量低，导致使用过程中用量大，劳作强度大，使用不方便 等。
3 养分分解慢，肥效慢，不能及时的供应植物生长过程中所需的营养，必须与化肥配合使用。
4 饲料的使用导致动物粪便含有大量重金属，以动物粪便为原料的有机肥在使用后可能导致土壤重金属污染。
5 自制有机肥发酵不彻底可导致各类病原微生物传染土壤，对作物形成多种土传性病害。
6 部分常规有机肥PH值未经调和，PH太酸或者太碱，对土壤环境及作物生长不利。

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